Студентският съвет на МУ-София се състои от студенти и докторанти, представители на всеки факултет и на Медицински колеж „Йорданка Филаретова“ и Филиал Враца. 

Органите на управление на Студентския съвет са: 

• Общото събрание на СС 

• Председателят на СС 

• Изпълнителният съвет на СС 

• Контролната комисия на СС